Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf13P61216 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf13P61216 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf13P61216 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf13P61216 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms