Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf3P61205 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf3P61205 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms