Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2iP60898 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2iP60898 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2iP60898 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2iP60898 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2iP60898 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2iP60898 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms