Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3eP60229 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms