Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp4P59240 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp4P59240 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms