Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dpf3P58269 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms