Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Snrpa1P57784 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Snrpa1P57784 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms