Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp25P57080 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp25P57080 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp25P57080 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp25P57080 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp25P57080 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp25P57080 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp25P57080 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp25P57080 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp25P57080 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms