Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cldn18P56857 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cldn18P56857 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Cldn18P56857 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn18P56857 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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