Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms