Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TdgP56581 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TdgP56581 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TdgP56581 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TdgP56581 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TdgP56581 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TdgP56581 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TdgP56581 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TdgP56581 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TdgP56581 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TdgP56581 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TdgP56581 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TdgP56581 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TdgP56581 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TdgP56581 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TdgP56581 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TdgP56581 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TdgP56581 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TdgP56581 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TdgP56581 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TdgP56581 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TdgP56581 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TdgP56581 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TdgP56581 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TdgP56581 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TdgP56581 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TdgP56581 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TdgP56581 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TdgP56581 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TdgP56581 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TdgP56581 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TdgP56581 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TdgP56581 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TdgP56581 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TdgP56581 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TdgP56581 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TdgP56581 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TdgP56581 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TdgP56581 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TdgP56581 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TdgP56581 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TdgP56581 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TdgP56581 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TdgP56581 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms