Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc1a3P56564 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms