Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp5P56399 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp5P56399 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp5P56399 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp5P56399 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp5P56399 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp5P56399 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms