Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp1P55194 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms