Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pex2P55098 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pex2P55098 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms