Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms