Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms