Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NrlP54846 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrlP54846 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NrlP54846 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NrlP54846 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NrlP54846 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NrlP54846 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NrlP54846 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NrlP54846 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NrlP54846 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NrlP54846 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NrlP54846 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NrlP54846 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NrlP54846 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NrlP54846 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NrlP54846 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms