Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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