Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cux1P53564 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cux1P53564 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cux1P53564 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cux1P53564 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cux1P53564 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cux1P53564 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cux1P53564 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cux1P53564 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms