Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fgd1P52734 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd1P52734 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms