Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CntfP51642 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CntfP51642 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CntfP51642 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CntfP51642 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfP51642 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CntfP51642 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CntfP51642 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CntfP51642 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CntfP51642 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CntfP51642 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CntfP51642 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CntfP51642 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfP51642 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfP51642 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfP51642 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms