Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RoraP51448 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RoraP51448 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RoraP51448 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RoraP51448 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RoraP51448 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RoraP51448 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RoraP51448 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RoraP51448 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RoraP51448 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RoraP51448 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RoraP51448 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RoraP51448 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RoraP51448 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RoraP51448 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RoraP51448 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RoraP51448 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RoraP51448 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RoraP51448 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RoraP51448 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RoraP51448 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RoraP51448 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms