Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms