Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TspoP50637 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TspoP50637 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TspoP50637 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TspoP50637 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TspoP50637 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TspoP50637 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TspoP50637 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TspoP50637 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TspoP50637 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TspoP50637 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TspoP50637 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TspoP50637 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TspoP50637 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms