Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FmodP50608 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FmodP50608 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FmodP50608 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms