Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf10P50592 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf10P50592 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms