Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl5P50228 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl5P50228 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl5P50228 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl5P50228 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl5P50228 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl5P50228 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl5P50228 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl5P50228 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl5P50228 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl5P50228 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms