Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdhaP50136 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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