Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox2P48432 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox2P48432 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms