Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Resp18P47939 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Resp18P47939 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Resp18P47939 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms