Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl6P47911 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms