Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gli1P47806 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gli1P47806 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gli1P47806 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gli1P47806 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gli1P47806 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gli1P47806 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gli1P47806 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gli1P47806 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gli1P47806 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gli1P47806 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gli1P47806 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gli1P47806 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gli1P47806 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gli1P47806 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gli1P47806 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gli1P47806 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gli1P47806 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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