Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TesP47226 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TesP47226 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TesP47226 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TesP47226 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TesP47226 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TesP47226 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TesP47226 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TesP47226 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TesP47226 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms