Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf1P46099 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms