Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt1P46096 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt1P46096 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syt1P46096 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syt1P46096 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt1P46096 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt1P46096 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt1P46096 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt1P46096 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt1P46096 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms