Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms