Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clec3bP43025 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clec3bP43025 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec3bP43025 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec3bP43025 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec3bP43025 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec3bP43025 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Clec3bP43025 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clec3bP43025 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec3bP43025 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec3bP43025 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec3bP43025 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec3bP43025 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec3bP43025 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec3bP43025 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clec3bP43025 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clec3bP43025 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Clec3bP43025 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clec3bP43025 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Clec3bP43025 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clec3bP43025 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clec3bP43025 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clec3bP43025 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clec3bP43025 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec3bP43025 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec3bP43025 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec3bP43025 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clec3bP43025 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clec3bP43025 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec3bP43025 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clec3bP43025 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec3bP43025 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec3bP43025 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec3bP43025 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec3bP43025 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec3bP43025 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec3bP43025 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec3bP43025 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec3bP43025 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec3bP43025 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec3bP43025 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec3bP43025 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clec3bP43025 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clec3bP43025 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clec3bP43025 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clec3bP43025 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clec3bP43025 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clec3bP43025 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clec3bP43025 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms