Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp9P41245 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp9P41245 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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