Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbP41155 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbP41155 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbP41155 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbP41155 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbP41155 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbP41155 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbP41155 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbP41155 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbP41155 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbP41155 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbP41155 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbP41155 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbP41155 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbP41155 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbP41155 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbP41155 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbP41155 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbP41155 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbP41155 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbP41155 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbP41155 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbP41155 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbP41155 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LtbP41155 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbP41155 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LtbP41155 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbP41155 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LtbP41155 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LtbP41155 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbP41155 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbP41155 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LtbP41155 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbP41155 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbP41155 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbP41155 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbP41155 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbP41155 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbP41155 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbP41155 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbP41155 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbP41155 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbP41155 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbP41155 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbP41155 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms