Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms