Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox7P40646 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms