Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf1P39428 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf1P39428 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf1P39428 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf1P39428 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms