Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik2P39087 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik2P39087 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik2P39087 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik2P39087 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik2P39087 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik2P39087 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms