Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk2P38575 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk2P38575 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk2P38575 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk2P38575 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms