Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lig1P37913 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lig1P37913 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lig1P37913 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lig1P37913 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lig1P37913 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lig1P37913 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lig1P37913 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lig1P37913 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lig1P37913 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lig1P37913 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lig1P37913 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Lig1P37913 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms