Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpargP37238 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpargP37238 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpargP37238 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PpargP37238 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpargP37238 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpargP37238 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpargP37238 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpargP37238 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpargP37238 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpargP37238 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpargP37238 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpargP37238 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpargP37238 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpargP37238 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PpargP37238 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpargP37238 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpargP37238 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpargP37238 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpargP37238 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpargP37238 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpargP37238 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpargP37238 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpargP37238 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpargP37238 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PpargP37238 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PpargP37238 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpargP37238 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpargP37238 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpargP37238 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpargP37238 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpargP37238 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PpargP37238 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PpargP37238 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PpargP37238 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms