Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprkP35822 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprkP35822 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprkP35822 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprkP35822 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprkP35822 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprkP35822 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprkP35822 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprkP35822 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PtprkP35822 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PtprkP35822 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprkP35822 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PtprkP35822 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprkP35822 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprkP35822 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PtprkP35822 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprkP35822 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprkP35822 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprkP35822 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtprkP35822 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtprkP35822 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtprkP35822 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PtprkP35822 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PtprkP35822 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PtprkP35822 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PtprkP35822 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtprkP35822 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtprkP35822 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PtprkP35822 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtprkP35822 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtprkP35822 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtprkP35822 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtprkP35822 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PtprkP35822 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtprkP35822 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PtprkP35822 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtprkP35822 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PtprkP35822 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
PtprkP35822 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PtprkP35822 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtprkP35822 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PtprkP35822 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PtprkP35822 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PtprkP35822 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PtprkP35822 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PtprkP35822 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PtprkP35822 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms