Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfc1P35601 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms