Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2aP34056 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms